El periódico portugués Público se hace eco del reportaje que Lusa, Agência de Notícias de Portugal, hizo sobre Probioma
Bajo el título de Bactérias do Paleolítico, a medicina do futuro? el periódico lisboeta Público presenta un amplio reportaje llevado a cabo por la Agencia de Noticias Lusa, principal agencia de noticias en lengua portuguesa.
En el reportaje, se recogen las opiniones sobre el projecto Probioma expresadas por varios investigadores integrantes del consorcio transnacional, como los portugueses Ana Teresa Caldeira, Clara Costa, Cátia Salvador o José Mirão, o los españoles Cesáreo Sáiz Jiménez, coordinador del proyecto y Alfonso González, de la empresa Servicios Mineros de Andalucía.
Las cuevas paleolíticas, las cuevas submarinas y las minas “son nichos de biodiversidad desconocidos” según Ana Teresa Caleira, de la Universidad de Évora, quien expresa que “los microorganismos a veces se asocian a procesos de degradación del patrimonio y acaban por ser los malos de la película, pero tienen grandes potencialidades, y verlo desde el punto de vista de la valorización es uno de los grandes aciertos de este proyecto”
El periódico luso O Observador dedica un reportaje a PROBIOMA
El pasado 12 de Febrero apareció en el periódico digital portugués O Observador el artículo titulado Bactérias do Paleolítico, a medicina do futuro? En dicho artículo se repasan los objetivos del proyecto así como se entrevista a varios de los investigadores participantes.
Cuevas paleolíticas, cuevas submarinas y minas abandonadas constituyen una importante fuente para la obtención de microorganismos que han sobrevivido a los cambios en su hábitat a lo largo de miles de años, y que, prfecisamente debido a esta capacidad de supervivencia pueden esconder la clave para la elaboración de antibióticos y antitumorales .
Localizar las bacterias, analizar y estudiar su posible utilización en el campo de la medicina es un proceso complejo que requiere de una investigación meticulosa, que desarrollará el grupo de especialistas portugueses y españoles integrados en el Proyecto transnacional Probioma (Prospección en Ambientes Subterráneos de Compuestos Bioactivos con uso potencial para la Medicina, Agricultura y Medio Ambiente).
Muestreo en Mina La Poderosa, El Campillo (Huelva)
El pasado 5 de diciembre, en el marco de Probioma, miembros de la empresa Servicios Mineros de Andalucía y del IRNAS efectuaron una campaña de muestreo en la mina La Poderosa, situada en el término municipal de la localidad onubense de El Campillo.
La Poderosa es una mina antigua, posiblemente explotada desde la antigüedad y de la que se tiene noticias de labores hacia 1635. Su moderna historia minera comienza en 1857, año en el que la familia sevillana Santaló la puso en explotación. En 1874 pasó a ser propiedad de la compañía británica F.C. Hills & Co., que la explotó hasta que en 1904 pasara a manos de la también británica United Alkali Company Ltd., que la beneficiaría hasta 1924 en que cesó la explotación.
En el muestreo se recogió un total de ocho muestras, entre sedimentos, formaciones minerales y moonmilk con la intención de aislar mediante cultivo los microorganismos presentes en las mismas e investigar su posible producción de substancias bioactivas.
Muestreo en la Mina do Lousal y visita al centro Ciência Viva do Lousal, Mina de Ciência
El pasado 26 de Noviembre, los socios del proyecto PROBIOMA se desplazaron al Centro Ciência Viva do Lousal, Portugal, para conocer sus actividades y llevar a cabo un muestreo intensivo en la mina, con el objetivo de obtener bacterias y hongos tanto del aire de las galerías como de las distintas formaciones minerales y sedimentos existentes. El muestreo consistió en la extracción de sedimentos para su posterior procesado en laboratorio y el filtrado de aire utilizando el sistema SAS en tres puntos diferentes. El sistema SAS de recogida de muestras de aire consiste en un sistema de filtrado por el que se hace pasar un volumen de aire de 100 litros por minuto, quedando atrapadas las esporas y bacterias que se encuentren en este volumen de aire en placas de petri con medio de cultivo que posteriormente se incubarán para aislar los microorganismos presentes.
El Centro Ciência Viva do Lousal se sitúa en varios edificios de las antiguas instalaciones mineras, como la central eléctrica del complejo, que permaneció en activo dando servicio al complejo entre 1934 y 1992. Desde 2001, funcionan exclusivamente como museo de arqueología industrial, y ha sido sometido a diferentes adaptaciones para convertirlo en un espacio de divulgación de la ciencia y la tecnología. En la actualidad, cuenta con salas de exposiciones y módulos interactivos, una gruta virtual, un laboratorio, una sala de experimentos, un cibercafé, un auditorio, diferentes espacios lúdicos y un mirador. De la mina de Lousal se extrajo fundamentalmente pirita entre los años 1900 y 1988. La pirita, importante mena de hierro, se ve acompañada en esta mina de otros minerales como galena, esfalerita, pirrotina, marcasita, bournonita, tetraedrita, cobaltina, safflorita y oro nativo. En la actualidad, el conjunto de instalaciones, musealizado, representa un polo de atracción tanto turístico como para la divulgación y enseñanza de la geología y minería.
Primer muestreo en la antigua mina de San Juán (Paymogo, Huelva) en el marco de PROBIOMA
El pasado 19 de julio los miembros del Proyecto PROBIOMA llevaron a cabo un primer muestreo en la antigua mina de San Juan, localizada en el término municipal de Paymogo (Huelva). La intención de esta campaña fue la toma muestras de las que puedan aislarse microorganismos que potencialmente puedan producir compuestos bioactivos, ya que se ha comprobado que los ambientes subterráneos son una importante fuente de biodiversidad a menudo aún desconocida para la ciencia.
Entre los objetivos de esta campaña estaba valorar el posible interés de otras minas de la Faja Pirítica Ibérica además de las incluidas originalmente en el Proyecto
Entre estos microorganismos cavernícolas es relativamente frecuente la detección de una cierta capacidad de inhibición de otros microorganismos, que pueden actuar como competidores, en las complejas relaciones tróficas que se establecen en estos ambientes subterráneos. Este tipo de ambientes, con cuevas y minas como componentes destacados, suelen caracterizarse por ser oligotrofos, es decir, ambientes con nutrientes escasos (fuentes de carbono y nitrógeno)que permitan el desarrollo de la vida microbiana.
La mina de San Juan, que produjo en su día cobre y zinc, puede convertirse hoy día, gracias a la financiación europea de PROBIOMA, en una fuente de microorganimos productores de substancias de interés para la medicina, la agricultura o el medio ambiente.
Se secuencia el genoma de una cepa bacteriana productora de granaticina en el marco de PROBIOMA
Un equipo de investigadores del IRNAS y del Laboratório Hércules ha secuenciado una cepa bacteriana productora de granaticina, una substancia bioactiva contra bacterias Gram-Positivas.
La cepa C05 de Streptomyces parvus, se aisló en los muros del Mausoleo Circular, una de las tumbas de la necrópolis romana de Carmona. Estudios posteriores determinaron la capacidad de esta cepa para producir granaticinas, que manchaban con un característico color violeta las paredes de esta tumba.
Las granaticinas son policétidos aromáticos octacétidos que muestran actividad contra las bacterias Gram-positivas, que son producidas por otras especies del Género Streptomyces, pero no así por la cepa tipo de S. parvus, NRRL B-1455.
La secuencia del genoma de esta bacteria se ha depositado en GenBank, la base de datos de secuencias genéticas de los National Institutes of Health de Estados Unidos, una colección de disponibilidad pública de secuencias de ADN, y su referencia de acceso se ha publicado recientemente en la revista de la American Society for Microbiology
La referencia completa del trabajo es: Gonzalez-Pimentel, J.L., Jurado, V., Laiz, L., Saiz-Jimenez, C. 2019. Draft genome sequence of a granaticin-producing strain of Streptomyces parvus isolated from a Roman tomb in the Necropolis of Carmona, Spain. Microbiol Resour Announc 8:e01127-19.
Prospección en Ambientes Subterráneos de Compuestos Bioactivos Microbianos con uso potencial para la Medicina, Agricultura y Medio Ambiente (PROBIOMA)
Según la Organización Mundial de la Salud (OMS), existe una seria falta de nuevos antibióticos en desarrollo para combatir la creciente amenaza de la resistencia a los antimicrobianos. En un reciente informe se indica que solo ocho de los 51 nuevos antibióticos y productos biológicos en desarrollo clínico para tratar patógenos resistentes a antibióticos son tratamientos innovadores que podrían agregar valor a los medicamentos actuales que se ofrecen. La mayoría de los fármacos en la cartera clínica son modificaciones de las clases existentes de antibióticos y son solo soluciones a corto plazo.
Tedros Adhanom Ghebreyesus, director general de la Organización Mundial de la Salud considera que, “la resistencia a los antimicrobianos es una emergencia sanitaria global que pondrá en serio peligro el progreso de la medicina moderna. Hay una necesidad urgente de más inversión en investigación y desarrollo para generar antibióticos capaces de combatir las infecciones resistentes a antibióticos”.
La búsqueda de nuevos antibióticos en el siglo XX se centró inicialmente con la producción de compuestos bioactivos (CBA) por microorganismos del suelo. Posteriormente se dirigieron las investigaciones hacia los microorganismos marinos. Sin embargo, existe en la biosfera un nicho poco explorado y con prometedores resultados: los ambientes subterráneos. Las minas y cuevas son un excelente reservorio de nuevas especies de bacterias y hongos y de algunas de ellas se han obtenido antibióticos de interés. Sin embargo, las investigaciones en este tema no ha sido consideradas con toda la dedicación que merece, hasta el punto de que la microbiología de cuevas y minas de Portugal es desconocida, salvo unos pocos estudios efectuados sobre cuevas volcánicas de las Azores, muy diferentes en mineralogía y microorganismos de las cuevas de la Portugal continental, desarrolladas sobre calizas o granitos. El estudio microbiológico de ambientes subterráneos representa, por ello, una interesante línea de investigación al permitir explorar una gran diversidad de bacterias y hongos desconocidos y la posible producción de nuevas sustancias bioactivas.
Pero la búsqueda de compuestos bioactivos no está limitada solo a la medicina, sino también es necesaria en la agricultura. A este respecto hay que señalar la llamada de atención para los investigadores que representa la aparición de nuevas plagas que atacan a árboles frutales y es transmitida por insectos. Lo novedoso de nuestro proyecto y que lo diferencia de otros es que ninguno de los proyectos existentes enfoca la búsqueda en microorganismos de cuevas o minas, con una demostrada capacidad de producir compuestos bioactivos de reconocido interés. Por ello se ensayará la actividad biocida de los compuestos bioactivos sobre una selección de bacterias fitopatógenas.
Las características de la zona de la Faja Pirítica Ibérica (FPI) con las minas de pirita, manganeso, etc. configuran un nuevo escenario donde los microorganismos están sometidos a stress y a la necesidad de desarrollar un sistema metabólico capaz de hacer frente a la oligotrofia (carencia de nutrientes orgánicos) y la expresión de genes productores de compuestos bioactivos frente a otros organismos competidores por los escasos nutrientes disponibles en el ambiente, por lo que consideramos de gran interés la exploración de estos nichos subterráneos para nuevos microorganismos en. La existencia de la FPI en la zona POCTEP es un rasgo específico del territorio que permite la investigación de nuevos recursos, como los propuestos en este proyecto. La metodología innovadora, con la aplicación de la biotecnología y la biología molecular con el estudio del genoma completo y la transcriptómica da un valor añadido a este proyecto y permite ser optimista en la consecución de resultados.
Nuestro proyecto puede dar a conocer nuevas cepas de bacterias y hongos con potencial producción de CBA de interés para la medicina y la agricultura. Además, una tercera vertiente, es que este proyecto puede dar lugar al descubrimiento de cepas de microorganismos beneficiosos para el medio ambiente, por su capacidad para degradar compuestos xenobióticos, contaminantes de los suelos y aguas, por su producción de compuestos surfactantes, polisacáridos, lípidos, etc. con propiedades de mejora de los suelos agrícolas. Adicionalmente, la empresa participante, que dará acceso a los equipos de investigadores a estos ambientes subterráneos y participará en las campañas de muestreo, desarrollará proyectos centrados en el impulso de infraestructuras turísticas en las zonas en estudio, con el fin de incrementar el desarrollo y economía de las zonas que en su día tuvieron actividad minera, hoy abandonadas, y que se encuentran en regiones y comarcas deprimidas.