Os resultados esperados do projeto PROBIOMA podem ser agrupados em diferentes escalas de ação.
1. Geral. Promoção da excelência científica em centros de investigação e universidades na área de cooperação transfronteiriça. O projeto incentivará os parceiros a alcançarem um nível de excelência internacional nas suas áreas de atuação, com base nos resultados da investigação e desenvolvimento nos domínios científico-tecnológicos mais influentes, como a Biologia, Ecologia, Química, Bioquímica e Biotecnologia, que será enriquecida pela conceção de novos produtos (CBA) e processos. A cooperação, no âmbito deste projeto, permitirá aumentar a massa crítica dos beneficiários e a sua competitividade, bem como permitirá o acesso a tecnologias e tarefas científicas em que alguns parceiros são mais especializados do que outros, estabelecendo assim sinergias e melhorando as capacidades científicas de cada grupo e dos seus componentes.
2. Científica. No aspeto científico, o projeto PROBIOMA fornecerá resultados em vários campos da ciência: conhecimento da biodiversidade de minas e grutas do Alentejo, Algarve e Andaluzia ocidental. Isolamento de bactérias e fungos que podem ser descritos como novas espécies para a ciência. Investigação do potencial de microrganismos isolados para a produção de CBA de interesse para a medicina, a agricultura ou o meio ambiente. Demonstração em pequena escala do benefício potencial dos CBAs.
3. Regional. O projeto tem como objetivo dinamizar e valorizar uma parte do excelente Património Arqueológico Industrial, agora abandonado, na região de Huelva da Faixa Piritosa Ibérica, projetando roteiros de ecoturismo e Arqueologia Industrial, que serão colocados à disposição dos municípios locais. Além disso, o projeto permitirá avaliar a gruta do Escoural no Alentejo e as grutas do Algarve de um ponto de vista turístico e patrimonial, reforçando e melhorando as visitas e a experiência dos visitantes.
4. Social. O projeto PROBIOMA pode ajudar a criar postos de trabalho nas áreas onde as minas da bacia mineira do FPI estão localizadas no Alentejo e na Andaluzia e, nas grutas algarvias, para a sua posterior implementação (por exemplo, criação de cooperativas locais para o transporte e guia dos turistas para as áreas envolvidas nos itinerários desenhados pelo projeto na área ocupada pela Faixa Piritosa Ibérica na província de Huelva), educação ambiental (disseminação em escolas e institutos da área do passado industrial da mineração e seu impacto na região), etc.